主要是通過惡化鼠類的生存條件，降低環境對鼠類的容納量來實現。其中減少鼠的棲息場所、繁殖場所、飲水場所、斷絕食物來源較為重要。生態學滅鼠是綜合鼠害防治中很重要的一環。此法必須與其他方法配合，才可奏效。

通過改良環境，包括防鼠建筑、斷絕鼠糧、農田改造、搞好室內外環境衛生、鼠類隱蔽處所等，也就是控制、改造、破壞有利于鼠類生存的生活環境和條件，使鼠類不能在那些地方生存和繁衍。

環境滅鼠：老鼠需要水、食物以及隱蔽的棲息條件，才能生存和繁殖。因此，創造一個不適宜其生存的環境，就能使一個地方的鼠量大大下降，并能使滅鼠成果容易得到鞏固。所以我們首先要搞好環境衛生、住宅周圍的雜草、隨意堆放的物品，經常清掃室內外衛生，各種用具雜物收拾整齊，衣箱、衣柜以及書籍、鞋帽等要經常檢查，不使鼠類營巢。

斷絕老鼠的食物：鼠的食物不僅包括人的食物，還包括飼料、垃圾、食品行業的下腳料、糞便等，這些東西要存放在加蓋的而且沒有縫隙的容器內，使老鼠得不到食物而被動地去吃投放的毒餌，以達到消滅老鼠的目的。